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Stations d'analysesZone de Texte:                                                                  Conception et réalisation : Meriem Garfa-Traoré                                                                                   
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PLATEFORME D' IMAGERIE CELLULAIRE DE L'IFR94
Institut Necker Enfants Malades
Zone de Texte: EQUIPEMENTS_Stations d'Analyses Zone de Texte: 1er poste d'analyses                                                                                                                               IMARIS Ce logiciel, édité par la société Bitplane, vous permet de créer des représentations tridimensionnelles de vos données. Il permet également de : • Faire des films • Faire des mesures • Etudier le phénomène de colocalisation • Suivre au cours du temps un volume en 3D • Reconstruire automatiquement une arborescence dendritique                                                                                   Représentation 3D                               Colocalisation                                                                            Tracking de cellules                                     Arborescence dendritique   2ème poste d'analyses                                                                                                                           ImageJ  ImageJ est un logiciel d’analyse et de traitement d’image crée par Wayne Rasband (inspiré du célèbre NIH Image). Il peut s’installer sur tous les systèmes d’exploitation (Unix, Windows, Macintosh). C’est un logiciel libre  (vous pouvez l’installer sans droit administrateur). ImageJ est très complet pour l’analyse d’images (co-localisation, traitement de stacks (pile d'images), colorimétrie, recherche de contours, segmentation, projection z, overlay, filtres, 3D, création d'animations .AVI .GIF, déconvolution 3D, …). Site officiel : http://rsb.info.nih.gov/ij/   (pour charger le logiciel et les derniers plugins) Leica LAS AF et Zeiss LSM ImageBrowser Ces deux logiciels permettent d'ouvrir les fichiers sous format .lif (Leica) et .lsm (Zeiss) et réaliser quelques opérations de mise en page(overlay, échelle,...) et de transformer le format constructeur en Tiff, Avi,... Nous disposons d'une version sous licence de LAS AF permettant par exemple, de quantifier l'intensité de fluorescence dans une région d'intérêt (ROI), ou encore de faire des études de colocalisation.   3ème poste d'analyses                                                                                                                           Metamorph MetaMorph est un logiciel d'analyses et de traitements d'images, édité par la société Molecular Devices.  Cette version vous permet de déconvoluer des images prises en microscopie classique (ou confocale), de réaliser des reconstructions 3D, d'analyser et de traiter les images par des méthodes "classiques" (contraste, luminosité, filtres divers…)